Решением Правительства Республики Узбекистан организованы и функционируют региональные филиалы РЦСАД в городах Фергана (с 2013 г.), Самарканд (с 2014 г.) и Карши (с 2018г.).  В настоящее время ведется работа по организации Нукусского регионального филиала. Постановление Кабинета Министров Республики Узбекистан №11 "О мерах по организации деятельности Нукуского регионального филиала РЦСАД" от 09.01.2020г.

На сегодняшний день каждый филиал ежегодно оказывает комплексные услуги более 1500 детям с психофизическими нарушениями здоровья. Растёт обращаемость в региональные филиалы, которые также обслуживают детей соседних областей.